Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDL1Q96EA4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPDL1Q96EA4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPDL1Q96EA4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.8 ms