Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX21Q969T3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX21Q969T3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SNX21Q969T3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX21Q969T3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms