Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM63Q969Q1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM63Q969Q1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms