Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRF1Q92994 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRF1Q92994 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRF1Q92994 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms