Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TRIM41Q8WV44 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
TRIM41Q8WV44 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC42.58■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TRIM41Q8WV44 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
TRIM41Q8WV44 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.44■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.44■■■■■ 4.39
TRIM41Q8WV44 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms