Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD2Q8NHY2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFWD2Q8NHY2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFWD2Q8NHY2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms