Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEDD1Q8NHV4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD1Q8NHV4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD1Q8NHV4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms