Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLQ8NG68 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLQ8NG68 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLQ8NG68 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLQ8NG68 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLQ8NG68 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLQ8NG68 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms