Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF555Q8NEP9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF555Q8NEP9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.6 ms