Protein–RNA interactions for Protein: Q8N988

ZNF557, Zinc finger protein 557, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF557Q8N988 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF557Q8N988 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF557Q8N988 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF557Q8N988 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF557Q8N988 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF557Q8N988 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF557Q8N988 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF557Q8N988 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF557Q8N988 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF557Q8N988 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF557Q8N988 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF557Q8N988 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF557Q8N988 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms