Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC33Q8N5R6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC33Q8N5R6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC33Q8N5R6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms