Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA13Q8N1Q1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CA13Q8N1Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CA13Q8N1Q1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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