Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC65Q8IXS2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC65Q8IXS2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC65Q8IXS2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC65Q8IXS2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms