Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLAQ8IXN7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLAQ8IXN7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLAQ8IXN7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLAQ8IXN7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLAQ8IXN7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMKLAQ8IXN7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIMKLAQ8IXN7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMKLAQ8IXN7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMKLAQ8IXN7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMKLAQ8IXN7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMKLAQ8IXN7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMKLAQ8IXN7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLAQ8IXN7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLAQ8IXN7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLAQ8IXN7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms