Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2R2Q712K3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE2R2Q712K3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2R2Q712K3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms