Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNCKQ6P2M8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNCKQ6P2M8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms