Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCM7

SLC25A25, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A25Q6KCM7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A25Q6KCM7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A25Q6KCM7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A25Q6KCM7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A25Q6KCM7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A25Q6KCM7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A25Q6KCM7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A25Q6KCM7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A25Q6KCM7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A25Q6KCM7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC25A25Q6KCM7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A25Q6KCM7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms