Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM225Q6GV28 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM225Q6GV28 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms