Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFRP4Q6FHJ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFRP4Q6FHJ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms