Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E4F1Q66K89 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E4F1Q66K89 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E4F1Q66K89 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms