Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF220Q5VTB9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF220Q5VTB9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms