Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3CQ5T2N8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3CQ5T2N8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms