Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NUP188Q5SRE5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
NUP188Q5SRE5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NUP188Q5SRE5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP188Q5SRE5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUP188Q5SRE5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 931.3 ms