Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4BQ5PRF9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4BQ5PRF9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4BQ5PRF9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD4BQ5PRF9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms