Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NHLRC3Q5JS37 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHLRC3Q5JS37 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLRC3Q5JS37 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms