Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC93Q567U6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC93Q567U6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC93Q567U6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 356.7 ms