Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT71Q3SY84 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT71Q3SY84 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms