Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRIT3Q3SXY7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRIT3Q3SXY7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIT3Q3SXY7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms