Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBF2

WSCD2, WSC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD2Q2TBF2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WSCD2Q2TBF2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WSCD2Q2TBF2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WSCD2Q2TBF2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms