Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RRN3P1Q2M238 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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RRN3P1Q2M238 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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RRN3P1Q2M238 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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RRN3P1Q2M238 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RRN3P1Q2M238 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RRN3P1Q2M238 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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