Protein–RNA interactions for Protein: Q16739

UGCG, Ceramide glucosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UGCGQ16739 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UGCGQ16739 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UGCGQ16739 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UGCGQ16739 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UGCGQ16739 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UGCGQ16739 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UGCGQ16739 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UGCGQ16739 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UGCGQ16739 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UGCGQ16739 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UGCGQ16739 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UGCGQ16739 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UGCGQ16739 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UGCGQ16739 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UGCGQ16739 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UGCGQ16739 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UGCGQ16739 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UGCGQ16739 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UGCGQ16739 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UGCGQ16739 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UGCGQ16739 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UGCGQ16739 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UGCGQ16739 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UGCGQ16739 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UGCGQ16739 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UGCGQ16739 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UGCGQ16739 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UGCGQ16739 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UGCGQ16739 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UGCGQ16739 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UGCGQ16739 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UGCGQ16739 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms