Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC6Q16204 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC6Q16204 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC6Q16204 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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