Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USF2Q15853 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USF2Q15853 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USF2Q15853 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USF2Q15853 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USF2Q15853 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USF2Q15853 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USF2Q15853 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USF2Q15853 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USF2Q15853 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
USF2Q15853 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USF2Q15853 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USF2Q15853 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USF2Q15853 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USF2Q15853 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USF2Q15853 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USF2Q15853 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USF2Q15853 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USF2Q15853 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USF2Q15853 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USF2Q15853 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USF2Q15853 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USF2Q15853 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USF2Q15853 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USF2Q15853 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USF2Q15853 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USF2Q15853 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USF2Q15853 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USF2Q15853 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USF2Q15853 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USF2Q15853 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USF2Q15853 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USF2Q15853 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USF2Q15853 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USF2Q15853 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USF2Q15853 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USF2Q15853 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USF2Q15853 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USF2Q15853 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USF2Q15853 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USF2Q15853 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USF2Q15853 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USF2Q15853 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USF2Q15853 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USF2Q15853 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USF2Q15853 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USF2Q15853 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USF2Q15853 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USF2Q15853 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USF2Q15853 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USF2Q15853 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USF2Q15853 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USF2Q15853 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USF2Q15853 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USF2Q15853 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USF2Q15853 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USF2Q15853 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USF2Q15853 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USF2Q15853 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USF2Q15853 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USF2Q15853 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USF2Q15853 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USF2Q15853 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USF2Q15853 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USF2Q15853 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USF2Q15853 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USF2Q15853 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
USF2Q15853 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USF2Q15853 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USF2Q15853 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USF2Q15853 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USF2Q15853 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USF2Q15853 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USF2Q15853 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USF2Q15853 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USF2Q15853 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USF2Q15853 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USF2Q15853 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USF2Q15853 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USF2Q15853 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USF2Q15853 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USF2Q15853 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USF2Q15853 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USF2Q15853 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USF2Q15853 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USF2Q15853 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USF2Q15853 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USF2Q15853 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USF2Q15853 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USF2Q15853 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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