Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1D2Q14995 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1D2Q14995 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR1D2Q14995 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR1D2Q14995 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR1D2Q14995 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR1D2Q14995 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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