Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms