Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH18Q13634 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH18Q13634 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH18Q13634 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH18Q13634 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH18Q13634 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH18Q13634 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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