Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRSF5Q13243 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRSF5Q13243 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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