Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3Q12983 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BNIP3Q12983 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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