Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRJQ12913 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRJQ12913 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRJQ12913 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
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