Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX4Q06945 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX4Q06945 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237 ms