Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB2Q03252 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB2Q03252 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNB2Q03252 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms