Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DEFA5Q01523 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA5Q01523 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms