Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RELBQ01201 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RELBQ01201 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RELBQ01201 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RELBQ01201 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RELBQ01201 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RELBQ01201 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RELBQ01201 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RELBQ01201 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RELBQ01201 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RELBQ01201 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RELBQ01201 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RELBQ01201 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RELBQ01201 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RELBQ01201 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RELBQ01201 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RELBQ01201 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RELBQ01201 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RELBQ01201 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RELBQ01201 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RELBQ01201 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RELBQ01201 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RELBQ01201 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RELBQ01201 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RELBQ01201 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RELBQ01201 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RELBQ01201 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RELBQ01201 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RELBQ01201 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RELBQ01201 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RELBQ01201 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RELBQ01201 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RELBQ01201 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RELBQ01201 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RELBQ01201 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RELBQ01201 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RELBQ01201 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RELBQ01201 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RELBQ01201 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RELBQ01201 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RELBQ01201 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RELBQ01201 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RELBQ01201 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RELBQ01201 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RELBQ01201 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RELBQ01201 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RELBQ01201 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RELBQ01201 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RELBQ01201 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RELBQ01201 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RELBQ01201 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RELBQ01201 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELBQ01201 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELBQ01201 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELBQ01201 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELBQ01201 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELBQ01201 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELBQ01201 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELBQ01201 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELBQ01201 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELBQ01201 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELBQ01201 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELBQ01201 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELBQ01201 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELBQ01201 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELBQ01201 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELBQ01201 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELBQ01201 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELBQ01201 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELBQ01201 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELBQ01201 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELBQ01201 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELBQ01201 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELBQ01201 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELBQ01201 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELBQ01201 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RELBQ01201 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELBQ01201 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELBQ01201 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELBQ01201 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELBQ01201 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELBQ01201 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELBQ01201 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RELBQ01201 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELBQ01201 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELBQ01201 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELBQ01201 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELBQ01201 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELBQ01201 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELBQ01201 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELBQ01201 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELBQ01201 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELBQ01201 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELBQ01201 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELBQ01201 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELBQ01201 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELBQ01201 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELBQ01201 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELBQ01201 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELBQ01201 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms