Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD83Q01151 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD83Q01151 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD83Q01151 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD83Q01151 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD83Q01151 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD83Q01151 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD83Q01151 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD83Q01151 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD83Q01151 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD83Q01151 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD83Q01151 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD83Q01151 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD83Q01151 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD83Q01151 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD83Q01151 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD83Q01151 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD83Q01151 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD83Q01151 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD83Q01151 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD83Q01151 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD83Q01151 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD83Q01151 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD83Q01151 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD83Q01151 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD83Q01151 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD83Q01151 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD83Q01151 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD83Q01151 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD83Q01151 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD83Q01151 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD83Q01151 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD83Q01151 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD83Q01151 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD83Q01151 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD83Q01151 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD83Q01151 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD83Q01151 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD83Q01151 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD83Q01151 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD83Q01151 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD83Q01151 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD83Q01151 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD83Q01151 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD83Q01151 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD83Q01151 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD83Q01151 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD83Q01151 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD83Q01151 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD83Q01151 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD83Q01151 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD83Q01151 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD83Q01151 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD83Q01151 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD83Q01151 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD83Q01151 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD83Q01151 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD83Q01151 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD83Q01151 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD83Q01151 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD83Q01151 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD83Q01151 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CD83Q01151 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD83Q01151 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD83Q01151 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD83Q01151 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD83Q01151 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD83Q01151 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD83Q01151 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD83Q01151 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD83Q01151 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD83Q01151 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD83Q01151 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD83Q01151 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD83Q01151 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD83Q01151 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD83Q01151 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD83Q01151 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD83Q01151 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD83Q01151 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD83Q01151 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD83Q01151 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD83Q01151 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD83Q01151 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD83Q01151 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD83Q01151 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD83Q01151 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD83Q01151 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD83Q01151 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD83Q01151 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD83Q01151 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD83Q01151 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD83Q01151 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD83Q01151 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD83Q01151 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD83Q01151 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD83Q01151 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD83Q01151 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CD83Q01151 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD83Q01151 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms