Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCCQ00597 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCCQ00597 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCCQ00597 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCCQ00597 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms