Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2C1P98194 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP2C1P98194 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2C1P98194 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms