Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCNA1P78396 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNA1P78396 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNA1P78396 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNA1P78396 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms