Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC5P78333 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC5P78333 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC5P78333 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC5P78333 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC5P78333 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC5P78333 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC5P78333 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC5P78333 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC5P78333 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC5P78333 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC5P78333 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC5P78333 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC5P78333 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC5P78333 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC5P78333 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC5P78333 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC5P78333 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC5P78333 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC5P78333 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC5P78333 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC5P78333 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC5P78333 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC5P78333 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC5P78333 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC5P78333 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC5P78333 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC5P78333 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC5P78333 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC5P78333 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC5P78333 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC5P78333 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC5P78333 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC5P78333 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC5P78333 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC5P78333 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC5P78333 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC5P78333 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC5P78333 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GPC5P78333 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GPC5P78333 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GPC5P78333 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC5P78333 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC5P78333 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC5P78333 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC5P78333 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC5P78333 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC5P78333 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC5P78333 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC5P78333 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC5P78333 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC5P78333 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC5P78333 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC5P78333 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC5P78333 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC5P78333 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC5P78333 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC5P78333 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC5P78333 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC5P78333 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC5P78333 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC5P78333 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC5P78333 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC5P78333 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC5P78333 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC5P78333 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC5P78333 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC5P78333 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC5P78333 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC5P78333 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC5P78333 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC5P78333 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC5P78333 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC5P78333 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC5P78333 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC5P78333 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC5P78333 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC5P78333 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC5P78333 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC5P78333 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC5P78333 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC5P78333 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC5P78333 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC5P78333 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC5P78333 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC5P78333 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPC5P78333 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPC5P78333 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC5P78333 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC5P78333 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC5P78333 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC5P78333 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC5P78333 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC5P78333 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC5P78333 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC5P78333 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPC5P78333 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC5P78333 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC5P78333 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC5P78333 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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