Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBXN2AP68543 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBXN2AP68543 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBXN2AP68543 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms