Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113P63121 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms